车主垫付的医药费可以通过法律途径要回。根据《中华人民共和国民法典》相关规定，车主在事故中垫付的医药费属于人身损害赔偿范畴，可以通过交通部门调解或法院诉讼的方式寻求追回。不及时处理可能面临无法追回的风险。
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车主垫付医药费后，可选择通过交通部门调解或启动法律程序来要回。若事故双方对赔偿无争议，可选择交通部门调解快速解决；若存在争议，建议向法院起诉，通过法律程序明确赔偿责任并追回垫付费用。
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针对车主垫付医药费的问题，具体操作如下：首先保留好垫付的证据；然后向交通部门申请组织赔偿调解；若调解无果，可向法院提起诉讼，要求肇事方赔偿垫付费用；最后，在法院判决生效后，如果对方不履行赔偿义务，可以申请强制执行。