不合法。单位无故扣工时违反《劳动法》，应按时足额支付劳动报酬。长期扣工时可能导致员工权益受损，引发劳动争议。
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单位扣工时常见处理方式是协商或申请劳动仲裁。若扣工时情况较轻，可先与单位协商；若协商无果或情况严重，应申请劳动仲裁维护权益。
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扣工时违法。处理方式：1. 与单位沟通，要求说明扣工时原因并提供依据；2. 若沟通无果，收集证据如工时记录、工资条等；3. 向劳动仲裁机构申请仲裁，必要时可诉诸法院。