商家拒赔食品异物1000元，您可向工商部门投诉。依据《消费者权益保护法》，商家应保障食品安全，拒绝赔偿可视为侵害消费者权益，工商部门将介入调查处理。若不及时处理，可能导致您的权益受损且无法获得应有赔偿。
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商家拒赔，常见处理方式有向工商投诉或消费者协会反映。选择时，若希望快速解决且保留证据充分，可选工商投诉；若需专业调解，则消费者协会更适合。
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商家拒赔应这样处理：1.保留好食品异物证据，拍照或录像；2.向工商部门投诉，提供详细情况说明和证据；3.或拨打消费者协会电话投诉，等待专业人员处理。若工商或消协处理无果，可考虑法律途径维权。